linux服务器中木马怎么处理
以下从几个方面在说明Linux系统环境安排配置防范和木马后门查杀的方法：
一、Web Server（以Nginx为例）
1、为防止跨站感染，将虚拟主机目录隔离（可以直接利用fpm建立多个程序池达到隔离效果）
2、上传目录、include类的库文件目录要禁止代码执行（Nginx正则过滤）
3、path_info漏洞修正：
在nginx配置文件中增加：
if ($request_filename ~* (.*)\.php) {
set $php_url $1;
}
if (!-e $php_url.php) {
return 404;
}
4、重新编译Web Server，隐藏Server信息
5、打开相关级别的日志，追踪可疑请求，请求者IP等相关信息。
二.改变目录和文件属性，禁止写入
find -type f -name \*.php -exec chmod 444 {} \;
find -type d -exec chmod 555 {} \;
注：当然要排除上传目录、缓存目录等；
同时最好禁止chmod函数，攻击者可通过chmod来修改文件只读属性再修改文件！
三.PHP配置
修改php.ini配置文件，禁用危险函数：
disable_funcions = dl,eval,exec,passthru,system,popen,shell_exec,proc_open,proc_terminate,curl_exec,curl_multi_exec,show_source,touch,escapeshellcmd,escapeshellarg
四.MySQL数据库账号安全：
禁止mysql用户外部链接，程序不要使用root账号，最好单独建立一个有限权限的账号专门用于Web程序。
五.查杀木马、后门
grep -r –include=*.php ‘[^a-z]eval($_POST’ . grep.txt
grep -r –include=*.php ‘file_put_contents(.*$_POST\[.*\]);’ . grep.txt
把搜索结果写入文件，下载下来慢慢分析，其他特征木马、后门类似。有必要的话可对全站所有文件来一次特征查找，上传图片肯定有也捆绑的，来次大清洗。
查找近2天被修改过的文件：
find -mtime -2 -type f -name \*.php
注意：攻击者可能会通过touch函数来修改文件时间属性来避过这种查找，所以touch必须禁止
六.及时给Linux系统和Web程序打补丁，堵上漏洞
服务器被中了木马,如何清除?
这是一种典型的挂马，黑客将你的服务器攻陷后(有时甚至不用攻陷），通过修改你网站代码，来达到抓肉鸡，赚取点击量或者其他什么目的。
首先，第一次出现的代码是比较原始的窗口弹出（就是将"http://iisa1.eyesir.net:7777/gethostjs.php"中的广告以窗口方式弹出）而第二次的代码是经过修改的（实际上也是达到同样的目的，但通过修改代码，用等价代码替换，可以绕过杀软的查杀,但庆幸的是最后还是被查杀了）
要做到这个其实不难，这个黑客最有可能是通过注入，得到网站后台密码，再上传木马，得到webshell，在通过webshell来上传修改过的网站源码。另外，跨站方式也是有可能的，如果你的服务器有多个网站，黑客就可以通过别的网站来控制服务器，进而修改你的网站。还有其他方式比如弱口令等，但概率不大。
我推荐你一个黑客工具：啊D，你到网上搜一下，下载下来，可以用它来检测你的网站是否有注入漏洞。
最后提醒你一句：自从出现了黑客，网站都没有绝对安全。既然黑客已经入侵了你的服务器，说明你的网站绝对有漏洞，要尽快修补。还有，按照惯例，黑客入侵后一般会在服务器中留后门或是木马（而且很有可能经过免杀，杀软查不出来），你即使将刚才几个东西删除了，黑客还有可能卷土重来。最后，即将广告代码删了，保不齐黑客还会在服务器中留其他挂马语句（而且被修改的更变态，杀软无法查出,或是这句挂马语句不是用来弹窗的，而是用来植入木马的，这种挂马如果做得好根本没有任何外在表现）
祝你好运。
（纯手工答复）
如何彻底清理木马病毒？
木马病毒.建议下载安装木马专杀工具:
1. 木马克星iparmor 5.47 build 0714 简体版 。
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4. iparmor 木马克星 简体中文 5.47 Build 0714 采用纯动态监视网络连接技术，可以有效查杀目前绝大多数黑客程序 。
5. 木马清除大师BeatTrojan V2.35 Build 0531 BeatTrojan是Lofocus安全实验室为网络游戏爱好者。
6. Anti-HackerTrojan Expert(反黑客木马专家) 2003 Build 1.6 反黑客专家能智能检测和清除超过12000多种黑客程序和木马程序。
7. 木马分析专家 2005 V6.73 木马分析专家能自动分析、终止可疑进程、窗体类型及木
8. 木马终结者 V2.7 特洛伊木马病毒一种破坏力十分强的黑客病毒。
9. 金山木马专杀 下载版
服务器被木马攻击怎么办
目前比较流行的ASP木马主要通过三种技术来进行对服务器的相关操作。
一、使用FileSystemObject组件
FileSystemObject可以对文件进行常规操作
可以通过修改注册表，将此组件改名，来防止此类木马的危害。
HKEY_CLASSES_ROOT\Scripting.FileSystemObject\
改名为其它的名字，如：改为FileSystemObject_ChangeName
自己以后调用的时候使用这个就可以正常调用此组件了
也要将clsid值也改一下
HKEY_CLASSES_ROOT\Scripting.FileSystemObject\CLSID\项目的值
也可以将其删除，来防止此类木马的危害。
注销此组件命令：RegSrv32 /u C:\WINNT\SYSTEM\scrrun.dll
禁止Guest用户使用scrrun.dll来防止调用此组件。
使用命令：cacls C:\WINNT\system32\scrrun.dll /e /d guests
二、使用WScript.Shell组件
WScript.Shell可以调用系统内核运行DOS基本命令
可以通过修改注册表，将此组件改名，来防止此类木马的危害。
HKEY_CLASSES_ROOT\WScript.Shell\
及
HKEY_CLASSES_ROOT\WScript.Shell.1\
改名为其它的名字，如：改为WScript.Shell_ChangeName或WScript.Shell.1_ChangeName
自己以后调用的时候使用这个就可以正常调用此组件了
也要将clsid值也改一下
HKEY_CLASSES_ROOT\WScript.Shell\CLSID\项目的值
HKEY_CLASSES_ROOT\WScript.Shell.1\CLSID\项目的值
也可以将其删除，来防止此类木马的危害。
三、使用Shell.Application组件
Shell.Application可以调用系统内核运行DOS基本命令
可以通过修改注册表，将此组件改名，来防止此类木马的危害。
HKEY_CLASSES_ROOT\Shell.Application\
及
HKEY_CLASSES_ROOT\Shell.Application.1\
改名为其它的名字，如：改为Shell.Application_ChangeName或Shell.Application.1_ChangeName
自己以后调用的时候使用这个就可以正常调用此组件了
也要将clsid值也改一下
HKEY_CLASSES_ROOT\Shell.Application\CLSID\项目的值
HKEY_CLASSES_ROOT\Shell.Application\CLSID\项目的值
也可以将其删除，来防止此类木马的危害。
禁止Guest用户使用shell32.dll来防止调用此组件。
使用命令：cacls C:\WINNT\system32\shell32.dll /e /d guests
注：操作均需要重新启动WEB服务后才会生效。
四、调用Cmd.exe
禁用Guests组用户调用cmd.exe
cacls C:\WINNT\system32\Cmd.exe /e /d guests
通过以上四步的设置基本可以防范目前比较流行的几种木马，但最有效的办法还是通过综合安全设置，将服务器、程序安全都达到一定标准，才可能将安全等级设置较高，防范更多非法入侵。
网站中病毒或者有木马怎么处理
网站其实本身肯定是不会中病毒的，只能是服务器里面存储的蓝本文件里面比如说某些图片和下载文件里面会存在木马病毒，而遇到了木马病毒后最好的办法自然就是想办法给电脑杀毒了，可以用电脑管家的病毒查杀功能，在服务器里面找出病毒查杀了，就行了。